Фильм Восхождение Юпитер критикуют за множество логических несостыковок и нелепых сцен: актеры не вживаются в роли (например, не мерзнут в холод), абсурдные ситуации (рождение в контейнере на корабле), нелогичные действия персонажей (почему пришельцы не заметили Юпитер рядом с Кэтрин), технические недочеты (невидимость, которая не спасает от выстрелов) и сюжетные дыры (стирание памяти у миллионов людей невозможно технически). Также высмеивают дизайн инопланетян (слишком похожие на людей), глупые диалоги и нелепые объяснения (например, пчелы кусают только королей). Фильм обвиняют в неуважении к зрителю из-за множества несоответствий и нелепых решений.