Фильм Матрица: Перезагрузка полон нелогичных сцен, ошибок и несоответствий. Критика включает: нелепые диалоги, несогласованные действия персонажей, визуальные глюки (исчезающие объекты, несуществующие элементы), проблемы с физикой (невозможные прыжки, разрушения), несоответствия в деталях (разные ракурсы, пропадающие предметы). Фильм страдает от плохой логики, нестыковок в сюжете и визуальных недоработок.