Фильм Люди в чёрном 2 критикуют за множество логических несоответствий, нелепые спецэффекты и слабый сюжет. В фильме встречаются абсурдные ситуации: пришельцы не умеют приземляться, злодейка Серлина исчезает без объяснений, а спецэффекты уступают первой части. Также отмечаются проблемы с реализмом: в Нью-Йорке 2002 года стоят разрушенные башни ВТЦ, а в метро нет людей, несмотря на катастрофу. Юмор и диалоги часто выглядят неестественно, а некоторые сцены — просто нелепыми. В целом, фильм считается худшим в серии из-за небрежного сценария и низкого качества исполнения.