Фильм Ученик чародея критикуют за множество логических несостыковок и нелепых сюжетных поворотов. Герои совершают необъяснимые поступки: Бальтазар оставляет опасные артефакты без присмотра, Моргана внезапно меняет цели, а магия работает только когда это удобно сюжету. Критики отмечают нелогичные действия персонажей, игнорирование базовых правил магии, а также массовые совпадения, которые двигают историю. Фильм обвиняют в поверхностном подходе к фэнтези-вселенной, где законы магии подчиняются не логике, а потребностям сценария.
