2023 год. Мир на пороге катастрофы. Разрушительные климатические катаклизмы сотрясают планету, а на улицах Нью-Йорка вспыхивает смертоносный инопланетный вирус «Манхэттен», заживо разлагающий людей. В этот хаос отправляют отряд морской пехоты для эвакуации важного ученого, но их подводная лодка атакована неизвестными силами.
Выживший морпех с позывным Алькатрас приходит в себя на берегу разрушенного мегаполиса. Легендарный Пророк передает ему свое главное оружие — Нанокостюм версии 2.0. Теперь Алькатрас — последняя надежда человечества в войне на два фронта: против безжалостных наемников C.E.L.L. и пробудившейся внеземной угрозы — Цефов. Либо мы спасем этот город, либо он станет нашей братской могилой.